Alata Bahçe Kültürleri Araştırma Enstitüsü, 1944 yılında kurulan "Alata Teknik Bahçıvanlık Okulu" bünyesinde 02.11.1967 tarihli Makam oluru ile "Bölge Bağ-Bahçe Araştırma Enstitüsü" adı altında kurulmuş ve 01.03.1972 tarihinde Enstitü ve Okul birleştirilerek "Bölge Zirai Araştırma Enstitüsü ve Ziraat Meslek Okulu" adını almıştır. Daha sonra 09.04.1974 tarihinde Enstitü ile Okul tekrar ayrılarak, Enstitünün adı "Bahçe Kültürleri Araştırma ve Eğitim Merkezi" olarak değiştirilmiştir. 1981 yılı Eylül ayında Tarım Meslek Lisesi kapatılarak bu kuruluşun personel ve mal varlıkları Araştırma Enstitüsüne devredilmiştir. 1985 yılında Enstitü sahası içerisinde bulunan Eğitim ve Dinlenme Tesisleri hizmete girmiştir.
Bakanlığımız Teşkilat ve Görevleri hakkındaki 3161 sayılı Kanun çerçevesinde Bakanlığımız Araştırma kuruluşlarının teşkilat ve çalışma esaslarını düzenleyen 01/08/1986 tarihli Makam Oluru ile "Bahçe Kültürleri Araştırma Enstitüsü" adını almıştır.Son olarak 26.02.1998 tarihli Makam Oluru ile Kuruluş
“Alata Bahçe Kültürleri Araştırma Enstitüsü” adını alarak halen bu isim altında çalışmalarına devam etmektedir.
Dünden Bugüne Alata Bahçe Kültürleri Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü